131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4188 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  100 
 
 
135 aa  264  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  48.85 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  44.93 
 
 
142 aa  110  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  52.38 
 
 
134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  45.38 
 
 
173 aa  103  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  42.11 
 
 
133 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  42.66 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  38.3 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  38.69 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  38.57 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  34.97 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  34.46 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  61.54 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  65.96 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  33.78 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  35.94 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  33.11 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  33.58 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  31.5 
 
 
156 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  30.95 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  32.28 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  43.24 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  39.74 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  45.9 
 
 
154 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0044  UspA domain protein  44.62 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412949  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  39.68 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  39.29 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2441  UspA domain protein  45.1 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186084  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  27.34 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  41.43 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  33 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  42.62 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.67 
 
 
283 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4434  UspA domain protein  47.06 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.99 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  33.01 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0832  UspA domain protein  46.15 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  37.88 
 
 
281 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  40 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  29.59 
 
 
278 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 
144 aa  47  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3893  UspA domain protein  40 
 
 
161 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  38.03 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  42.05 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  45.45 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  37.8 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.31 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 
285 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  37.93 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  44.23 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.41 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  34.34 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.94 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 
314 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  51.16 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  31.58 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  39.71 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  40.68 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 
145 aa  43.9  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.73 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  29.85 
 
 
306 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  29.9 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  36.11 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  32.59 
 
 
281 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  29.2 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  35.82 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  38.36 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  32.93 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  32.94 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  30.67 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 
153 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 
133 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  45.45 
 
 
153 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  27.07 
 
 
144 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  33.72 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  33.73 
 
 
297 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.93 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  26.28 
 
 
287 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  34.33 
 
 
279 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  32.2 
 
 
279 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.58 
 
 
156 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  35.29 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  40.85 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  33.72 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  38.33 
 
 
300 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  39.71 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  33.72 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  40.3 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  39.22 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.85 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  43.1 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.31 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>