216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 137 aa  264  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  39.84 
 
 		 130 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  41.09 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  38.35 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  40.62 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  40.31 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  39.84 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  42.31 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  38.93 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  37.4 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  40.31 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  34.35 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  34.59 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  36.84 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  32.58 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  37.37 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  37.31 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  33.59 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  33.59 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  30.71 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  31.06 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  37.78 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  30.4 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  35.79 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  41.73 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  40.79 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  25.78 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  39.08 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  37.23 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.86 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  31.5 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  39.39 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  32.26 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  37.66 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  31.45 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  30.3 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.37 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.62 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.47 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  38.35 
 
 		 294 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  38.35 
 
 		 294 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.27 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  50.98 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  36.99 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.57 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  43.06 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  26.39 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  35.71 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  36.36 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  32.56 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  42.5 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.87 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.67 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  46.94 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  28.91 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  36.49 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  41.89 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  43.08 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  26.62 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  44.44 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  28.89 
 
 		 289 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  42.86 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  44 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  37.84 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  49.02 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  24.79 
 
 		 311 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  42 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  48.08 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  48.08 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  34.51 
 
 		 303 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  39.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  41.18 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  42.31 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 290 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  37.66 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  32.43 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  28.06 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.23 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  26.62 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.81 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  29.6 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 297 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  44.23 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 293 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.5 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  36.54 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>