136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1992 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  100 
 
 		 125 aa  237  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  50.38 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  50.77 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  51.16 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  46.27 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  47.29 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  51.15 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  52.53 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  48.06 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  46.56 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  44.19 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  44.19 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  43.41 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44.62 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  39.2 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  40.77 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  41.48 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  42.75 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  42.75 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  38.85 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  40.48 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  41.79 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  40 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  46.05 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  43.84 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  35.38 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  44.44 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  48.68 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  42.47 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  31.75 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  30.4 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  42.19 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  44.29 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  36.99 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  37.68 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  45 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  35.2 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  42.86 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  55.36 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  42.42 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  40.22 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  40.22 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  40.22 
 
 		 201 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  38.57 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3366  UspA domain protein  38.21 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731635  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  40.22 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  40.91 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  40.22 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  40.22 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  41.18 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.89 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  27.78 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  40.38 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.73 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.4 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.47 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  35.87 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  37.66 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  32.59 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  51.02 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  34.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  37.74 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.5 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  37.66 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  36.71 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.36 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  30.68 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4576  UspA domain-containing protein  34.96 
 
 		 276 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  44.9 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  34.57 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.54 
 
 		 288 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  36.62 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  36.99 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  36.92 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  34.33 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.51 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  38.46 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  33.33 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.99 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  39.06 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>