288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2967 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  57.69 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  53.08 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  46.92 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  51.88 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  53.08 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  51.94 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  49.62 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  61.76 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  48.84 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  49.25 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  45.38 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  47.69 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  44.62 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  54.69 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  45.45 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  45.8 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  45.38 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  43.75 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  50 
 
 		 125 aa  94  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  36.03 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  41.79 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  48.75 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  37.68 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  40.86 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  40.6 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  35.16 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  34.04 
 
 		 217 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  46.25 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  34.81 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  56.86 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  52.73 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  37.36 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  41.67 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  43.84 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.26 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  51.06 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  48.08 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.51 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  35.43 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  30.47 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  35.8 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  34.07 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  48.15 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  39.58 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  37.33 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.88 
 
 		 317 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.14 
 
 		 299 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  48 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  43.48 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  36.59 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  42.47 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  41.67 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  36.73 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  33.02 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.11 
 
 		 200 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  35.8 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  43.1 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.14 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.08 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  35.05 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  41.18 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  40.32 
 
 		 307 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  37.68 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.75 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  35.53 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 291 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  26.98 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  44.64 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  44 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  44.64 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  44.23 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  33.73 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  44.64 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  44.64 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  44.64 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  44.64 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  40 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  31.85 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.37 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  36.73 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  35.56 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.22 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 277 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  32.62 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  34.88 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>