152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0629 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  75.97 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  66.92 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  66.92 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  48.06 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  46.92 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  47.69 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  46.51 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  44.19 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  44.53 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  44.53 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  40.74 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  43.65 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  43.65 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  43.65 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  41.54 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  42.06 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  38.93 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  39.69 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  39.69 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  44.66 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  42.97 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  32.58 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  36.64 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  37.5 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  37.59 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  37.04 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  33.83 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  40.54 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  44 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  33.85 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  34.85 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  40.79 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  47.27 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  31.82 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  41.77 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  63.16 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  34.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  38.3 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  41.54 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  33 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  35.06 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  32.74 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  29.13 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 289 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  29.1 
 
 		 316 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  28.12 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  37.78 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  40 
 
 		 300 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  43.08 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  50 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  33.77 
 
 		 311 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  33.8 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  37.5 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  26.9 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  35.44 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  31.31 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  32.71 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  27.59 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  31.11 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  39.22 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  38.6 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  38.6 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  38.6 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  38.6 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  38.6 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  38.6 
 
 		 164 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 277 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.57 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.57 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  40 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  26.56 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  34.25 
 
 		 281 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  28 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  47.62 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  32.95 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  30.65 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  30.89 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  40.38 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.18 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.87 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  25.64 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.87 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  40.32 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  33.81 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  33.81 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  33.8 
 
 		 200 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 291 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  25 
 
 		 149 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>