144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6378 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  46.81 
 
 		 165 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 		 165 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  46.81 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  47.14 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  46.81 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  46.81 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  46.81 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  46.81 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  46.81 
 
 		 163 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  46.81 
 
 		 163 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  46.1 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  47.14 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  46.81 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  46.43 
 
 		 154 aa  119  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  45.71 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  45.71 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  45.71 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  34.51 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  33.8 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.39 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  33.58 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  33.58 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.54 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.47 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  36.73 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  27.86 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  31.72 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.47 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.62 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.65 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  30.23 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.53 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  25.53 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  29.25 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.34 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  31.43 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.64 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  34.35 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  29.51 
 
 		 273 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  26.67 
 
 		 309 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  30.56 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.71 
 
 		 295 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  32.86 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  33.73 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  25.53 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.2 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  26.97 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  26.17 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  25.83 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.82 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  24.52 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.34 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.9 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.81 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 291 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  30.58 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  25.35 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  31.11 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  28.91 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  26.62 
 
 		 300 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  22.54 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  29.73 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  31.16 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  35.37 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  23.94 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.03 
 
 		 298 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.25 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  26.09 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  25.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  26.62 
 
 		 301 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  23.74 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  34.85 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.64 
 
 		 287 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  26.9 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>