282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3382 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  51.72 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  51.03 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  44.37 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  37.93 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  36.73 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.64 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.59 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  31.47 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  30.87 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  30 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  29.68 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  30.12 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  35.62 
 
 		 303 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  30.12 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.99 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.77 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.45 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  34.03 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  28.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  28.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  28.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  28.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  28.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  28.86 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  32.88 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  35.9 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  28.86 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  28.86 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.87 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.25 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  38.75 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30.57 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  29.66 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  32.17 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  32.17 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  32.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  32.86 
 
 		 295 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.14 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.53 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  40.91 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  40.91 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.25 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  28.47 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  37.65 
 
 		 296 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.58 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  23.78 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  27.78 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.97 
 
 		 187 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  41.54 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.86 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.17 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.72 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  34.96 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  29.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.3 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  30.77 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  28.87 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 250 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.43 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.03 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  40 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.78 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>