238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1934 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  46.85 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  42.48 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  42.48 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  42.48 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  42.48 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  42.48 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  41.84 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  41.13 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  39.33 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  38.67 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  38.67 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  38.67 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  38.67 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  38.67 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  38.67 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  38.67 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  35.46 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  32.21 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  33.57 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  32.21 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.51 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.76 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.11 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  32.47 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.38 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.08 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.52 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  32.45 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.66 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  25.32 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.33 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  23.61 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.39 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.61 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  24.84 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  32.87 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  33.82 
 
 		 280 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  32.87 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  26.85 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  29.66 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  23.4 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  32.17 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  28.08 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  28.67 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  29.53 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  27.7 
 
 		 283 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.79 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.06 
 
 		 295 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  26.43 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  22.64 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.77 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  35.04 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  28.03 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  29.8 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  32.31 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.68 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  27.39 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  27.16 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 297 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.87 
 
 		 297 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.16 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  25.33 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  30.87 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  32.12 
 
 		 280 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  21.66 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1666  UspA domain protein  32.26 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.189674  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.38 
 
 		 287 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  27.97 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  25 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  26.47 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.84 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>