More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1633 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  93.79 
 
 		 154 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  93.79 
 
 		 154 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  86 
 
 		 165 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  86.67 
 
 		 165 aa  270  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  86.67 
 
 		 165 aa  270  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  86.67 
 
 		 165 aa  270  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  86 
 
 		 165 aa  269  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  85.33 
 
 		 165 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  84.42 
 
 		 163 aa  269  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  85.33 
 
 		 165 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  83.12 
 
 		 163 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  83.12 
 
 		 163 aa  265  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  82.47 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  82.47 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  82.47 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  82.47 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  82.47 
 
 		 163 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  46.1 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  41.46 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  38.73 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.86 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  29.45 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.68 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.21 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.37 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.91 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  34.75 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  34.75 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.79 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  24.82 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  25.48 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.28 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.5 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.69 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.8 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  35.25 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  28.83 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.26 
 
 		 287 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.57 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.76 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.89 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.87 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.97 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.61 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  27.56 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.66 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  33.33 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.94 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.95 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.87 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.55 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.26 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.19 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  29.66 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.76 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  29.46 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.04 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.2 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  29.5 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.4 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.06 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.86 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.62 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  25.64 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  25.64 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  24.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  24.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  24.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  24.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  24.83 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.4 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>