More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1856 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  100 
 
 		 163 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  99.39 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  99.39 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  96.32 
 
 		 163 aa  323  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  86.5 
 
 		 165 aa  290  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  86.5 
 
 		 165 aa  290  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  88.46 
 
 		 165 aa  288  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  89.1 
 
 		 165 aa  288  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  85.28 
 
 		 165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  85.28 
 
 		 165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  87.82 
 
 		 165 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  88.28 
 
 		 154 aa  266  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  86.9 
 
 		 154 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  85.52 
 
 		 154 aa  258  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  46.81 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  36.43 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  39.84 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  34.97 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  38.24 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.5 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  34.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  34.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.71 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25.36 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.04 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.58 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  26.47 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.17 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25.33 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.24 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  30.82 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.87 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  25.55 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.38 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.08 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.47 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.93 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.84 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.97 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  27.86 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.17 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.22 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  32.28 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  24.03 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  29.17 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.75 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  29.84 
 
 		 296 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  29.2 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  30.83 
 
 		 311 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.41 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.4 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  26.76 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.27 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.38 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.41 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  24.09 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  32.41 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  30.5 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  27.41 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  28.4 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  25.55 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.88 
 
 		 295 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.76 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.2 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.78 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  33.61 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  24.83 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  27.97 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  25.71 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.34 
 
 		 305 aa  50.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  23.74 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.7 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  25.34 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  26.03 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  32.86 
 
 		 303 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>