More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3227 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  291  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  68.06 
 
 		 145 aa  209  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  66.21 
 
 		 145 aa  206  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  66.9 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  65.52 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  36.43 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  36.43 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  36.43 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  36.43 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  36.43 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  35.71 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  35 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  36.43 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  36.43 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  36.43 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  36.43 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 165 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  31.47 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.77 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.82 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  31.47 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  31.47 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.27 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.68 
 
 		 314 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  31.51 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.87 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  33.12 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.53 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  32.19 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.97 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.46 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.08 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  29.05 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.62 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30.82 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  30.5 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  29.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  34.21 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.48 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.25 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  30.46 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  29.68 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.22 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.05 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  30.46 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1807  putative universal stress protein  28.77 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.317331 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.07 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  32.03 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  31.47 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  29.45 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  31.47 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  27.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  28.38 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  29.3 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25.34 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.3 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  32.17 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.47 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3732  UspA domain protein  31.51 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.212348  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.07 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  30.07 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  30.07 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  45.61 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>