More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1841 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  100 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  100 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  44.29 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.46 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.55 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.84 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  36.17 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  37.84 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.86 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.97 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.92 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  35.46 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  34.27 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  35.46 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
165 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  35.46 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.82 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  34.04 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  34.04 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  34.04 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  34.04 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  31.47 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  33.58 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.25 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  36.76 
 
 
280 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  30.5 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.29 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.25 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.77 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
449 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30.56 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.56 
 
 
180 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.51 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.88 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.56 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.82 
 
 
288 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  28.87 
 
 
217 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  33.33 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.99 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  27.97 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  36.11 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.86 
 
 
294 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  34.04 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  31.97 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  30.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  25.69 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  30.28 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  29.61 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  29.08 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  27.08 
 
 
310 aa  53.9  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28.86 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  24.68 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  24.68 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
137 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.29 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  29.17 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.87 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  30.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  30.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  30.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  30.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  28.97 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  30.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.57 
 
 
283 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.51 
 
 
142 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  26.71 
 
 
153 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  29.17 
 
 
144 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>