293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4718 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  294  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  81.38 
 
 		 145 aa  244  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  79.31 
 
 		 145 aa  238  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  66.9 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  66.67 
 
 		 145 aa  205  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  32.17 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  32.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  32.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  32.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  32.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  32.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  31.94 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  32.14 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  32.14 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  31.47 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  30.99 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  32.17 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  31.47 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  32.87 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  35.37 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  35.37 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.39 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.17 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  39.78 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.76 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  32.19 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.67 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.51 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.94 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.86 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  31.72 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.47 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.51 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  31.47 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.67 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  32.19 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  28.03 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  28.03 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  31.51 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.97 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  31.41 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  30.71 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.8 
 
 		 314 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 		 314 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.03 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  30.14 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.41 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.41 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.03 
 
 		 180 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  33.09 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.26 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.41 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  27.33 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  30 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.33 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.16 
 
 		 308 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.85 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  33.73 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  30 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.17 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  28.47 
 
 		 289 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  35.66 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.76 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>