38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5745 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  321  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  94.41 
 
 		 143 aa  246  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  41.46 
 
 		 154 aa  94.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  40.65 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  40.65 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  40.65 
 
 		 163 aa  94  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  39.84 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  39.84 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  39.84 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  39.84 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  39.84 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  40.65 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  37.16 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  40.65 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  35.81 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  32.19 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  32.19 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.23 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  30.56 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 141 aa  51.2  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  24.59 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  22.03 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  30.89 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.79 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  33.62 
 
 		 294 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.19 
 
 		 143 aa  42  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  27.64 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>