36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6498 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  283  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  94.41 
 
 		 161 aa  245  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  38.97 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  38.97 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  38.13 
 
 		 163 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  38.24 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  38.24 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  38.24 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  37.06 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  38.24 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 165 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  38.24 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  38.13 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  38.13 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 165 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 165 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  35.66 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  31.94 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.2 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  29.79 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  31.16 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  24.79 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.29 
 
 		 297 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.48 
 
 		 294 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  30.33 
 
 		 162 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  28.33 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.25 
 
 		 283 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  24.58 
 
 		 143 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>