More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0620 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  281  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  46.85 
 
 
162 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  44.29 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  44.29 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  41.55 
 
 
154 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 
165 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  42.25 
 
 
165 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  41.55 
 
 
165 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 
165 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 
165 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  40.14 
 
 
154 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  41.55 
 
 
165 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  41.26 
 
 
145 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  40.14 
 
 
163 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  40.14 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  40.14 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  40.14 
 
 
163 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  40.14 
 
 
163 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  40.14 
 
 
163 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  40.14 
 
 
163 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  40.14 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  39.44 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  37.06 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  34.51 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  33.8 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.17 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  34.69 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.42 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.57 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  33.11 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.17 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.19 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.37 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
143 aa  67  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  31.25 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.56 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  33.09 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.45 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.71 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.08 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.82 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.72 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  30.71 
 
 
166 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  31.25 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 
128 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  31.25 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.25 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  31.69 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  32.64 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.99 
 
 
164 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  27.67 
 
 
180 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.25 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.25 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  24.48 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  25.81 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  34.78 
 
 
280 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  29.05 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  31.94 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.54 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.82 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.16 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  31.72 
 
 
309 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.92 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.9 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  28.57 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  34.75 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  35.21 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.74 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  27.66 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  34.51 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>