193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2749 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  68.06 
 
 		 145 aa  209  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  66.67 
 
 		 145 aa  205  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  65.97 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  62.5 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  34.97 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  34.97 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  34.97 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  34.97 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  34.97 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  34.97 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  34.97 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  34.01 
 
 		 163 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  34.01 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  33.57 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  33.57 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  34.51 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  32.65 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  32.88 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  30.5 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  30.5 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.34 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  40.96 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.72 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  31.01 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  39.76 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.91 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.78 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.43 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  32.19 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  29.11 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  29.11 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.57 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.73 
 
 		 314 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.65 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.56 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  28.67 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  29.14 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  34.01 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  29.03 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.39 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.75 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  29.8 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  31.47 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.39 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 449 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  26.58 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.1 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.41 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  31.72 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.72 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  22.54 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  43.64 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  29.73 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  33.02 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.87 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.06 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  27.03 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  26.95 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30.82 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.38 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.19 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  31.07 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  26.76 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.66 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  24.66 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>