More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1493 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  96.97 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  96.36 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  96.36 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  96.36 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  96.36 
 
 		 165 aa  324  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  88.68 
 
 		 163 aa  291  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  86.5 
 
 		 163 aa  290  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  86.5 
 
 		 163 aa  290  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  86.5 
 
 		 163 aa  290  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  86.5 
 
 		 163 aa  290  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  86.5 
 
 		 163 aa  290  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  85.89 
 
 		 163 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  85.89 
 
 		 163 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  86.9 
 
 		 154 aa  264  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  86.9 
 
 		 154 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  85.52 
 
 		 154 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  46.81 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  43.14 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 		 144 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  36.43 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5745  hypothetical protein  35.81 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6498  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  34.01 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.91 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.76 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2183  universal stress family protein  36.17 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1841  UspA domain protein  36.17 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  32.17 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.01 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.41 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.99 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  26.67 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.08 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.5 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.08 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.8 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  30.86 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.58 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.99 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.45 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  30.25 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  31.51 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  24.64 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  28.19 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.66 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  25.31 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  32.08 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.67 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.29 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.7 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  32.67 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  33.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.94 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.17 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  34.69 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  30.41 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.21 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  27.61 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.84 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  31.88 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  25.31 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.7 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.2 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  26.49 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  32 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.46 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  24.48 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  28.99 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  31.25 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.4 
 
 		 300 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.88 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  25.62 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  29.84 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.75 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.77 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>