More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5095 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  100 
 
 
177 aa  370  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  58.62 
 
 
182 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  58.62 
 
 
182 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  45.68 
 
 
157 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  45.06 
 
 
157 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  42.5 
 
 
157 aa  140  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  41.67 
 
 
180 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  45.86 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  42.68 
 
 
175 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  44.94 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  42.5 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  40.62 
 
 
164 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  40 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  37.97 
 
 
160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  37.58 
 
 
154 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  32.92 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 
143 aa  82  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  31.93 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  31.85 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  32.91 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.69 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 
152 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  31.21 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.38 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  31.85 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  31.65 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.97 
 
 
138 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  27.44 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3293  hypothetical protein  34.62 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15731  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  30.82 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  42.17 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  34.38 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.91 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.9 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  34.38 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.03 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  28.85 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  28.85 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.63 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  28.85 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1674  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  28.85 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  28.85 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  25.62 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  28.75 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  28.21 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  30.19 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.48 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.22 
 
 
304 aa  67.8  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  30.57 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  33.75 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 
145 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  30.32 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.22 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.03 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.45 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  28.21 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.57 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2132  universal stress protein  29.94 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0989997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.83 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.56 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.55 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.48 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.38 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.03 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  29.01 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.67 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  29.94 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  28.93 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  28.57 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  29.56 
 
 
144 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  29.56 
 
 
144 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  29.56 
 
 
144 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  29.01 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  29.56 
 
 
144 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  23.9 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  25.64 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  25.62 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  29.56 
 
 
144 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  25.62 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>