More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1131 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  100 
 
 
138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  50.72 
 
 
138 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  36.69 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  40 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  41.3 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  37.32 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.55 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  36.05 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.06 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.09 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  36.62 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  36.62 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.51 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  37.06 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.21 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  34.04 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  38.3 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  36.11 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.25 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  33.79 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  37.14 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.79 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.78 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  37.86 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  33.33 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.86 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  34.04 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.58 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  34.04 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  30.97 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  34.04 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  34.04 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.21 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  34.04 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  35.37 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.71 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  31.58 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  34.04 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.1 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  35.71 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  30.94 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  36.05 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  30.94 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  32.62 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.47 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  34.53 
 
 
166 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  33.82 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.75 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.46 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  35.86 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.72 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.69 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  33.33 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>