More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0646 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  306  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  33.99 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.33 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  33.77 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.46 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.48 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.37 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.38 
 
 
314 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.45 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  33.33 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  28.28 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.19 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  28.77 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  32.17 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.22 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1791  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.933223  normal  0.40622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  26.85 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  26.32 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  28.19 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  28.86 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.26 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.66 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  28.86 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.22 
 
 
156 aa  58.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.03 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
297 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.89 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.45 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  32.24 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.67 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  32.28 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  31.58 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.53 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  27.78 
 
 
159 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  31.13 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.33 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  30.41 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.69 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  30.46 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  33.11 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  32.08 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.28 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.14 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.39 
 
 
320 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  31.47 
 
 
283 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.47 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.17 
 
 
288 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  32.21 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.56 
 
 
280 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.56 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.77 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.14 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.72 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.94 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  25.71 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.52 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.41 
 
 
290 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  32.24 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  29.25 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.45 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.86 
 
 
288 aa  55.1  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.56 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32.43 
 
 
187 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.45 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  29.33 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  25.17 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.33 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  32 
 
 
289 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>