More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1290 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  334  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  42 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  45.58 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  39.87 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  39.87 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  37.91 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  40.41 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  40.41 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  40.41 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  40.41 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  40.41 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  40.41 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  40.41 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  40.41 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  40.41 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  41.89 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  39.87 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  39.1 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  35.86 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.67 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  35.86 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  42.38 
 
 		 145 aa  99  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.24 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.56 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.31 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.73 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  36.73 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.56 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.48 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  34.03 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.43 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.1 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.51 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  34.48 
 
 		 283 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.97 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  35.62 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.34 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  33.79 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.43 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.1 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.19 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  30.32 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  29.01 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  30.32 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.41 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  30.3 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  29.01 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  30.46 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  29.73 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.46 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.45 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  29.01 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.77 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  25.52 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.85 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  28.28 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  24.83 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  28.77 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  27.33 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.33 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.05 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.29 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  32 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.51 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  30.86 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.33 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  24.14 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  27.7 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  29.66 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.93 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.9 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.49 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  29.05 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.25 
 
 		 286 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>