More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2109 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  100 
 
 
128 aa  246  6e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  75.78 
 
 
128 aa  192  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  41.01 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  42.66 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36.81 
 
 
143 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  40.58 
 
 
138 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  41.13 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  39.33 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.32 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.19 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.46 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.8 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  35.97 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.43 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  39.69 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.9 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  38.41 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  34.56 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  38.03 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.33 
 
 
208 aa  82  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  34.97 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  36.36 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  38.3 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  35.66 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  34.97 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  34.97 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  34.97 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  34.97 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40.44 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  34.97 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  38.73 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  35.66 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  37.06 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  41.73 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  37.24 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  37.32 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.43 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.03 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  40.14 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.25 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.85 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  39.16 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  39.6 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.86 
 
 
145 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.23 
 
 
290 aa  77  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35 
 
 
307 aa  77  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
158 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  34.85 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  38.03 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  36.55 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  38.69 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  39.01 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  33.09 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.08 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.1 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.76 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.88 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  37.24 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.88 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  36.43 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  35.17 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  33.79 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.09 
 
 
286 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  36.81 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.28 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.97 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.57 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  38.41 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  33.09 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.92 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.9 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  36.69 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.21 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.27 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  36.99 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.21 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  34.31 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  34.78 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.88 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>