162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1612 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1791  UspA domain-containing protein  87.5 
 
 		 136 aa  249  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.933223  normal  0.40622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1651  UspA domain-containing protein  55.15 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.825176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0728  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1709  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.478002  normal  0.0298137 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0742  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0631  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  26.98 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  26.72 
 
 		 293 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.14 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.97 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  25.38 
 
 		 293 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  26.21 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 		 297 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  33.59 
 
 		 283 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.98 
 
 		 415 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.95 
 
 		 320 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.95 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  26.47 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25.9 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.82 
 
 		 304 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  27.66 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  40 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  40 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 274 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  26.87 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  27.27 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  26.9 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.28 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  40 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  25.35 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.18 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  27.27 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25 
 
 		 287 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.82 
 
 		 297 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.17 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  25.17 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  23.78 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  27.86 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  26.19 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  25 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2742  hypothetical protein  25.16 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.17 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  25 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  27.46 
 
 		 303 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  24.16 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.29 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.86 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  27.97 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 291 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.69 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  25.69 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  23.97 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  26.71 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  26.95 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  26.39 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  22.64 
 
 		 515 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  24.11 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.08 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  22.86 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  26.81 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  24.8 
 
 		 324 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.46 
 
 		 863 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  24.09 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  26.19 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  24.09 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  24.09 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0826  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.50516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  24.26 
 
 		 156 aa  42  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>