92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0826 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0826  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  301  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.50516  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.33 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  25.97 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.2 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  31.17 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.49 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  25.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  30.67 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  32 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  26.17 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  26.32 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.95 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.67 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  26.17 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  28.19 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  28 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.15 
 
 		 314 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  26.17 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.67 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  26.45 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  31.4 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.23 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  27.92 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  28.03 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  31.3 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  28.03 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  27.34 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.3 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  27.33 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.17 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2086  UspA domain protein  28 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  32.17 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  24 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  26.15 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.9 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  30.13 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.83 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  27.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  28.8 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1612  UspA domain protein  26.53 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.53 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  24.83 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  26.36 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  30.68 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  26.58 
 
 		 281 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26 
 
 		 307 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.23 
 
 		 140 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.68 
 
 		 415 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.5 
 
 		 154 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  27.15 
 
 		 145 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  25.33 
 
 		 138 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 147 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 		 281 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  26.83 
 
 		 169 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  28.8 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  26.17 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  27.69 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  27.48 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  27.27 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.92 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  29.79 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  29.14 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.01 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  28.35 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  24.84 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  28.35 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  25.97 
 
 		 307 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>