243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3779 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3779  UspA domain protein  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  32.62 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  27.21 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.37 
 
 		 291 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  27.59 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  25 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  29.17 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.47 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.99 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.87 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.13 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  31.76 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  31.76 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  26.35 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  24.14 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.43 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 318 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.93 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.71 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  26.06 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  27.46 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  28.97 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  29.08 
 
 		 390 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  27.7 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.67 
 
 		 320 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.15 
 
 		 307 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  28.17 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  23.61 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  26.76 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 449 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  23.78 
 
 		 187 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  28.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  28.06 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  28.06 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  28.06 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  27.46 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  27.15 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  28.17 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  28.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  28.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  28.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  28.06 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  23.78 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  27.46 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  27.59 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  23.78 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27.08 
 
 		 325 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.03 
 
 		 304 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  30.94 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  27.59 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  28.48 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.29 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  26.81 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.48 
 
 		 314 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.14 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  25 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  26.04 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  39.22 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  24.16 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.67 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  21.83 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  27.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  27.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  23.78 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.85 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>