More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2179 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2622  universal stress protein  53.42 
 
 		 145 aa  167  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  32.86 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.86 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 288 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 289 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  29.23 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.43 
 
 		 317 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  31.51 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.94 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 292 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.62 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  30.5 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.34 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.88 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.42 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  30.07 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.04 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  32.89 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.34 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  29.93 
 
 		 307 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  23.74 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  28.08 
 
 		 345 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  29.94 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  31.47 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.56 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  30.71 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  26.24 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  30.28 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.72 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.14 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  31.51 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  30.28 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  25.9 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.79 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  34.75 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.12 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.84 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  32.86 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.72 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  27.66 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  27.86 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.78 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.1 
 
 		 284 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  24.65 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  27.59 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  29.1 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  32.64 
 
 		 292 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  29.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  29.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  29.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  29.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  29.58 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  32.61 
 
 		 305 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  31.72 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.34 
 
 		 288 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05020  universal stress protein UspA-like protein  35.42 
 
 		 293 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  29.58 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.37 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  32.89 
 
 		 289 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.65 
 
 		 325 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.69 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  28.06 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  28.47 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  28.06 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  26.95 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  26.98 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  27.94 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3608  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358614  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  27.94 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>