More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1409 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  100 
 
 		 152 aa  309  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  50.64 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  37.66 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.79 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  34.04 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  35.92 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.97 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.8 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.82 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.72 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  32.64 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.87 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.86 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.71 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  28.37 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.37 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.86 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.75 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  28.28 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.34 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.91 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.69 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  29.86 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.07 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.17 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.86 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.14 
 
 		 290 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  31.72 
 
 		 292 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 292 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  30.14 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.22 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.97 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  27.66 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  31.21 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  31.21 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.53 
 
 		 320 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  31.03 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  31.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  31.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  31.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  31.29 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  31.29 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  31.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  31.21 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  30.41 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  34.48 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30.5 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  32.14 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.17 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  29.79 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  30.41 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.78 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  31.72 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  27.86 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  31.21 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.64 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  31.33 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  28.19 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.43 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.28 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>