More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1517 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  40.85 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.29 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  37.86 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.97 
 
 		 154 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  34.81 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  37.32 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.72 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.33 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  29.93 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.79 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  35.37 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  35.17 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  34.72 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.14 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  32.87 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.37 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  32.19 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  33.54 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  29.58 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.03 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  26.71 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  32.87 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.53 
 
 		 304 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.87 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  33.09 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.82 
 
 		 276 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  34.53 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  30.5 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.34 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  35.29 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  34.53 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.5 
 
 		 300 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  29.58 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  38.19 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  32.86 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.61 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.79 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  33.09 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  30.07 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.41 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  28.97 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  28.87 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.53 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.28 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.07 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.28 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.57 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  28.57 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.88 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  32.17 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.73 
 
 		 306 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1409  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.21 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.37 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.79 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  32.62 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  26.45 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.37 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  31.54 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.14 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  29.29 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.5 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  32.2 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  27.4 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.19 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.99 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.07 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.33 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.85 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  28.08 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  29.66 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  29.45 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  32.14 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  33.1 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>