233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4155 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  340  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  35.77 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  34.06 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  36.23 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  32.86 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  34.38 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  32.61 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.76 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  38.06 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  50 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  29.71 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  33.55 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  44.12 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  26.43 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.58 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.94 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  29.71 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  35.95 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  34.01 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  33.78 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  33.82 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  33.78 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  35.77 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.5 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.09 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.62 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  37.68 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  40 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  37.68 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  40.68 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  50 
 
 		 300 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  29.71 
 
 		 140 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  24.09 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  24.09 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  24.09 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  53.57 
 
 		 297 aa  51.6  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  33.82 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  24.09 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  35.76 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  24.09 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.5 
 
 		 141 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  36.96 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  23.36 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  28.28 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  36.43 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  27.27 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  41.43 
 
 		 281 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.61 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.07 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  32.58 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  42.86 
 
 		 296 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  24.09 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  23.36 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  40 
 
 		 278 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.06 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  32.9 
 
 		 279 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  33.82 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.81 
 
 		 294 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  47.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.39 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  33.57 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3464  UspA domain protein  43.24 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  30.3 
 
 		 308 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  25.53 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  30.82 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.72 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  43.08 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>