More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4478 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  313  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  70.59 
 
 		 170 aa  217  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  54.78 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  58.23 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  58.33 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  53.57 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  35.21 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  34.04 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  34.44 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  31.21 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  34.25 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  34.25 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  33.57 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.44 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4157  putative universal stress protein UspA  36.62 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.09 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  36.17 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  35.42 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  34.67 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  34.25 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.97 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.55 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.97 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.43 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  32.88 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  31.51 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32.43 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  26.8 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.27 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.91 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  26.8 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.19 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  31.25 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  35.17 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  34.97 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  34.44 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.26 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.69 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.71 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  31.47 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  30.82 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  31.08 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  28.57 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  29.86 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.17 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  35.81 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  35.81 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  35.81 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  34.72 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.61 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  31.43 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  32.17 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  33.57 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  26.43 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.47 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.87 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  30.87 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  31.54 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  31.93 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  30.99 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  34.23 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  30 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  30.87 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  27.78 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.21 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.57 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  25.43 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  30.67 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  30.41 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>