159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1204 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  56.32 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  47.52 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  46.81 
 
 		 141 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  44.44 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  43.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  43.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  43.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  43.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  43.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  52.29 
 
 		 144 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  40.97 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  39.58 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  46.79 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  38.89 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  37.14 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  33.57 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  33.57 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  34.25 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  34.27 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  32.62 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.14 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.38 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.94 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.97 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4157  putative universal stress protein UspA  35.46 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  29.58 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  31.69 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.08 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.65 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.92 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.65 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  28.97 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  29.05 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  33.33 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  28.17 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.05 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.27 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  25.17 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  26.21 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  27.1 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.77 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  26.39 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 310 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  28.17 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.27 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  27.43 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  26.47 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  34.55 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  25.36 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  34.15 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  27.66 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  28.28 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  26.06 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.09 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.22 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  25 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  28.17 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  27.78 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.61 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  31.25 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  28.97 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.7 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.93 
 
 		 306 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  29.37 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  24.49 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.95 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  32.26 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.29 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.54 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 137 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  33.03 
 
 		 283 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  30.34 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  23.02 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  34.75 
 
 		 325 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  27.15 
 
 		 295 aa  45.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>