91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1866 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  30.48 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  27.71 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  25.16 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 323 aa  99  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  25.71 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  25.4 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  24.38 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  26.01 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2827  hypothetical protein  28.71 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  21.3 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  23.1 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  31.41 
 
 		 151 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  29.01 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  22.4 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.27 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 150 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  30.07 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  28.3 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  27.67 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  27.63 
 
 		 162 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 145 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  26.74 
 
 		 169 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.22 
 
 		 160 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  24.36 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  29.48 
 
 		 161 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  25.15 
 
 		 163 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 140 aa  49.7  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 164 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.46 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  29.94 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  32.17 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.81 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.13 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.05 
 
 		 157 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.05 
 
 		 157 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.52 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  31.97 
 
 		 148 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  31.61 
 
 		 147 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 128 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  31.17 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  29.56 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  28.44 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  31.68 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.76 
 
 		 148 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  30.06 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  28.05 
 
 		 157 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  34.18 
 
 		 139 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  28.5 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  31.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  30.13 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  31.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.78 
 
 		 139 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  30.57 
 
 		 157 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 138 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  25.4 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1686  UspA domain protein  30.87 
 
 		 141 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00978672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  44 
 
 		 137 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 140 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.48 
 
 		 158 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.48 
 
 		 160 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  25.85 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 		 128 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  38 
 
 		 140 aa  42.7  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.87 
 
 		 157 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 140 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 159 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>