31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1249 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  100 
 
 		 144 aa  291  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  99.31 
 
 		 144 aa  288  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  95.14 
 
 		 177 aa  275  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  71.53 
 
 		 144 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  70.83 
 
 		 144 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  70.14 
 
 		 144 aa  207  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  71.13 
 
 		 144 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  70.14 
 
 		 144 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  68.75 
 
 		 144 aa  200  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  70.14 
 
 		 144 aa  197  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  47.92 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  46.53 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  43.75 
 
 		 187 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  47.22 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  34.75 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  32.64 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.2 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  26.21 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 164 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 143 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  30.09 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  26.9 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>