214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3264 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  88.65 
 
 		 141 aa  254  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  47.52 
 
 		 187 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  48.61 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  50.35 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  47.22 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  46.53 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  46.1 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  47.22 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  41.43 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  34.72 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  33.57 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  33.11 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.69 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  34.29 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.99 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  35.71 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.97 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.87 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  29.25 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  29.37 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  33.59 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  28.87 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  28.77 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.56 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  28.08 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.27 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  29.58 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  25.85 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  28.87 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  28.87 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.24 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  33.64 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  28.38 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.29 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.33 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.24 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.77 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.79 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  28.97 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  30.77 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.62 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.41 
 
 		 300 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  29.37 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  27.46 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.72 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  26.97 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  28.86 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  26.95 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.06 
 
 		 297 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  30.67 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.28 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  27.08 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  27.4 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  29.79 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  25.68 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.74 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.34 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  26.06 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  27.54 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.94 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  28.26 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  28.67 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  33.75 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  27.52 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>