35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5907 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  275  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  55.8 
 
 
138 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  41.43 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  39.29 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  37.14 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  36.17 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  35.66 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  34.75 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  34.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  34.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  34.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  34.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  34.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  34.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  35.92 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  35.92 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  33.8 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  33.8 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  33.1 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  33.1 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.67 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  26.27 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  25.55 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  25.87 
 
 
141 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  25.9 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.06 
 
 
287 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  26.67 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  26.67 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  26.67 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  26.67 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  25.42 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  26.67 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>