31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1487 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  100 
 
 
177 aa  360  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  95.83 
 
 
144 aa  277  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  95.14 
 
 
144 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  95.14 
 
 
144 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  95.14 
 
 
144 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  95.14 
 
 
144 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  95.14 
 
 
144 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  95.14 
 
 
144 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  72.22 
 
 
144 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  71.53 
 
 
144 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  71.53 
 
 
144 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  71.53 
 
 
144 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  71.83 
 
 
144 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  70.14 
 
 
144 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  70.83 
 
 
144 aa  198  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  48.61 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  47.22 
 
 
141 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  45.83 
 
 
173 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  32.64 
 
 
138 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.87 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
145 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  27.59 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  30.97 
 
 
152 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
156 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.27 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  26.9 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  25.58 
 
 
141 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>