115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5647 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  56.32 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  52.48 
 
 		 141 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  50.35 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  47.22 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  47.22 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  47.22 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  47.22 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  47.22 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  47.22 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  47.22 
 
 		 144 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  45.83 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  41.67 
 
 		 144 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  40.97 
 
 		 144 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  40.97 
 
 		 144 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  41.13 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  35.66 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  37.14 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.91 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1937  hypothetical protein  31.47 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.163086  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  31.76 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  31.47 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.69 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.1 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.69 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.45 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.14 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3869  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4157  putative universal stress protein UspA  37.18 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3142  UspA domain protein  31.97 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.47 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.05 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  28.06 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.97 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2127  universal stress protein family  29.37 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  28.17 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  39.29 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.59 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  23.29 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  28.37 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.88 
 
 		 300 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  26.76 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  27.46 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 282 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.57 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.77 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  25.34 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.43 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  27.59 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  28.67 
 
 		 277 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.56 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  29.17 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.12 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  25.16 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  31.72 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  28.67 
 
 		 750 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  31.71 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.25 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  26.32 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  25.87 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  25.53 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  26.76 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  26.95 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  31.21 
 
 		 325 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  28.37 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  25.9 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  28.37 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  25.34 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  25.35 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  26.76 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  25.69 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.22 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  32.19 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.03 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  28.37 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  30.91 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  23.57 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  27.66 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  28.67 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>