30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6291 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6291  putative universal stress protein (Usp)  100 
 
 		 144 aa  283  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.55 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  33.64 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.88 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  25.38 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  24.62 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  28.24 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  23.85 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  23.85 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  35.77 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  27.48 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  28.24 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  22.31 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  30 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  30 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  26.32 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  33.82 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  27.78 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  29.1 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  29.63 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  26.36 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  31.11 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  28.36 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  25.56 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  28.7 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  25.9 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  29.92 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>