More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1531 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  100 
 
 		 171 aa  353  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  35.97 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.3 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.27 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.04 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.43 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  32.17 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.87 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  29.37 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.71 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.49 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.39 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.03 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.5 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 289 aa  63.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.37 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.16 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  30.61 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.85 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.2 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.64 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  62  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.39 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.54 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.26 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.79 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.93 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.77 
 
 		 415 aa  60.8  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.5 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  30 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.37 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  31.39 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.38 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.99 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.38 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.47 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.37 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  32.41 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  26.04 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  29.79 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  31.91 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.66 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  31.13 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.17 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  28.67 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  30.26 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.61 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  28.37 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  31.97 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  30.99 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.43 
 
 		 301 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  29.63 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  26.95 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  26.03 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  27.74 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.61 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.4 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.62 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  29.68 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.19 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  27.97 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.34 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  33.33 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  27.89 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  30.67 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  27.33 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.45 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  30.94 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  27.89 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  26.71 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  27.54 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.17 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.86 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  28.77 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  29.58 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  27.54 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>