More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1529 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  274  4e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  33.11 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  36.23 
 
 
294 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  35.04 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.07 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.39 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.56 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  32.39 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.99 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.06 
 
 
288 aa  60.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.57 
 
 
159 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  32.61 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.39 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.51 
 
 
300 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  31.69 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  33.85 
 
 
297 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  32.19 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  30.08 
 
 
317 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  36.23 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.12 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.17 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.13 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  32.19 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.03 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.07 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.19 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 
317 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  31.72 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  31.51 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.34 
 
 
288 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  32.93 
 
 
176 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  30.94 
 
 
171 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  28.37 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.68 
 
 
281 aa  54.3  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
274 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  28.97 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.3 
 
 
207 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  35.11 
 
 
390 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  30.77 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  29.79 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 
297 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.75 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.39 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.47 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  28.77 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.56 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.17 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.88 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.56 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  25.35 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.28 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.71 
 
 
139 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  34.27 
 
 
141 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  29.1 
 
 
208 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.71 
 
 
287 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 
161 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  27.41 
 
 
297 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  31.47 
 
 
294 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.78 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.61 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.17 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
449 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.81 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  38.98 
 
 
295 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.88 
 
 
289 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.99 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.56 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  38.82 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  30.43 
 
 
284 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.07 
 
 
150 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
140 aa  50.1  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  30.2 
 
 
156 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.76 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26 
 
 
314 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  29.63 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  32.46 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.15 
 
 
297 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.43 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  31.21 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  29.46 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  29.63 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.32 
 
 
305 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>