More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1230 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  86.86 
 
 
137 aa  243  6e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  85.4 
 
 
137 aa  236  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  80.88 
 
 
137 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  48.94 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  43.88 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  46.04 
 
 
143 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  40.29 
 
 
140 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  44.53 
 
 
141 aa  103  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  39.57 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  41.84 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  40.43 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  38.13 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.06 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  37.59 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  39.57 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  34.78 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.97 
 
 
300 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  36.88 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  37.59 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.67 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  37.78 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.31 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.96 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  36.17 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.86 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  33.79 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  32.41 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.19 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.86 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.39 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.51 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  35.21 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  38.73 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.94 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  32.03 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.33 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.79 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  33.33 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.03 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.45 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  36.43 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.43 
 
 
290 aa  70.1  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.29 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  35.25 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  35.92 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  34.72 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.65 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  33.33 
 
 
301 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  40.71 
 
 
297 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.22 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.43 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  28.06 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.21 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  38.03 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  30.99 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3813  UspA domain protein  35.04 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.43 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.91 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  28.06 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  36.03 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32.37 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  34.69 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  32.64 
 
 
200 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  33.33 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.78 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.71 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.37 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>