More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2132 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  100 
 
 
171 aa  352  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  44.17 
 
 
163 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  40 
 
 
153 aa  104  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  38.61 
 
 
151 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  33.33 
 
 
142 aa  87.8  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.86 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.5 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.4 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  29.63 
 
 
143 aa  72  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.68 
 
 
150 aa  72  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.87 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.03 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  29.88 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.49 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  28.4 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  25.95 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.85 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  23.03 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  28.57 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  26.67 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  27.88 
 
 
162 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  25.81 
 
 
304 aa  61.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  27.74 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.11 
 
 
153 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  28.66 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25.61 
 
 
276 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  27.78 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  27.91 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  27.88 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.45 
 
 
296 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  27.11 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 
142 aa  58.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  25.32 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  23.12 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  26.51 
 
 
153 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  23.12 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  26.4 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.85 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  26.67 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  28.39 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  28.85 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  25.64 
 
 
138 aa  57.8  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 
145 aa  57.4  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  26.67 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 
145 aa  57.4  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  33.78 
 
 
300 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25.81 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  25.81 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  22.88 
 
 
303 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  23.67 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  33.33 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  25.16 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  24.12 
 
 
274 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  25.16 
 
 
515 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  36.25 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  23.23 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  32.89 
 
 
137 aa  55.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  34.72 
 
 
390 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 
145 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  30.38 
 
 
139 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  26.35 
 
 
180 aa  54.3  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  35.44 
 
 
144 aa  54.3  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 
141 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.32 
 
 
297 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  37.1 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  30.77 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  42.11 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  35 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.81 
 
 
320 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  26.38 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  24.71 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.76 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  37.68 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  35 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  38.46 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  32.5 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 
148 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  35.8 
 
 
137 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.54 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.7 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  52  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  24.55 
 
 
177 aa  52  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  32.14 
 
 
130 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.5 
 
 
314 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  24.68 
 
 
282 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5901  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
155 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.475966  normal  0.0916735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
160 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  35.9 
 
 
144 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  25.48 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  26.88 
 
 
147 aa  51.6  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  24.68 
 
 
141 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  22.78 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  31.65 
 
 
136 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  41.82 
 
 
144 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>