More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3081 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  28.82 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  28.4 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  29.31 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  27.75 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  31.21 
 
 		 276 aa  64.3  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  28.24 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.27 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  26.22 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  27.43 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  29.76 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  27.88 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  27.81 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  25.45 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  24.55 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.81 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.81 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  25.61 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.52 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  25.45 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  26.04 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.65 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  25.9 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  26.79 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  25.58 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.81 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  23.53 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.88 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.38 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  24.7 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  28.81 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  25.43 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  23.81 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  31.58 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  24.1 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  23.67 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  24.85 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  28.82 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  26.35 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  26.01 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  26.63 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  25.75 
 
 		 289 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  25.44 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  25.6 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  31.61 
 
 		 298 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6234  UspA domain-containing protein  25.88 
 
 		 316 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.49 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  25.45 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  22.54 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  24.55 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  30.46 
 
 		 304 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.32 
 
 		 301 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  25.3 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  26.86 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  27.53 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  26.59 
 
 		 308 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  25.3 
 
 		 143 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  28.66 
 
 		 298 aa  51.2  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  25.75 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  26.35 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  24.4 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  24.85 
 
 		 294 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  21.43 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.81 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  44.83 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1497  hypothetical protein  29.76 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1486  hypothetical protein  29.76 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  21.43 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  27.33 
 
 		 293 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  21.43 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  29.27 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  25.41 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.74 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  24.85 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  29.59 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  29.24 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  25.3 
 
 		 306 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  21.43 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  25.75 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25.29 
 
 		 290 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  25.6 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>