More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3170 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  100 
 
 
167 aa  319  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  45.32 
 
 
149 aa  111  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  38.89 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.3 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  34 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  39.73 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.78 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.11 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  38.46 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  35.25 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.62 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  38.57 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.41 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.23 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.33 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.44 
 
 
286 aa  73.9  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.51 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  33.57 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.32 
 
 
169 aa  72  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.21 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.82 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.91 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  37.59 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.65 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  34 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.16 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.59 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  36 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  36.36 
 
 
150 aa  70.5  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  36.43 
 
 
147 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.14 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  36.3 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  33.78 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.16 
 
 
297 aa  68.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.26 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.71 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.33 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.64 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  39.62 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  31.13 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  32.45 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.21 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.71 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.66 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  32.89 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.14 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  35.62 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.97 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.9 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  34.53 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  33.8 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.11 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  38.73 
 
 
301 aa  64.7  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.37 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  36.96 
 
 
305 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  32.62 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  37.32 
 
 
415 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.66 
 
 
300 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  33.56 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  33.56 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  33.56 
 
 
201 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  33.56 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  31.13 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  33.56 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  33.56 
 
 
201 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  31.13 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  34.75 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4281  UspA domain-containing protein  37.58 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0794331 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.21 
 
 
296 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.14 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  26.95 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  35.62 
 
 
147 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 
140 aa  61.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  34.25 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  31.54 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 
323 aa  61.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
138 aa  61.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  34.53 
 
 
142 aa  61.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32.47 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  32.64 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
155 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.88 
 
 
152 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.37 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  33.82 
 
 
281 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>