222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1767 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  290  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0583  UspA domain protein  54.79 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3208  UspA domain protein  51.35 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118961  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.67 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  29.86 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  36.36 
 
 
324 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.37 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.66 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.03 
 
 
187 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.97 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.67 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.64 
 
 
151 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.66 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  33.8 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  32.93 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 
144 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
147 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  34.04 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  34.01 
 
 
168 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.72 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.67 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.29 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  30.56 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  34.9 
 
 
151 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.29 
 
 
164 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.86 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  34.9 
 
 
151 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.71 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
449 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 
250 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.39 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  32.12 
 
 
295 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  28.47 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.39 
 
 
305 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  31.43 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  27.08 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  32.87 
 
 
311 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.8 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  32.88 
 
 
305 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
282 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  32.62 
 
 
280 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  32.14 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1807  putative universal stress protein  30.67 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.317331 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  28.97 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.21 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2254  UspA domain protein  36.44 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000796673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  30.71 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  30.71 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  30.71 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  30.71 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  30.71 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  30.71 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  30.71 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  30.71 
 
 
152 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  33.09 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  29.37 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  25.47 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  30.22 
 
 
138 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.86 
 
 
300 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.67 
 
 
143 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
167 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  30.15 
 
 
297 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.62 
 
 
139 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 
152 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  32.65 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.29 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  32.87 
 
 
297 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  30 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.28 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  31.72 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  32.39 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  26.21 
 
 
285 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>