99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3208 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3208  UspA domain protein  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118961  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  52.32 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0583  UspA domain protein  49.67 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.91 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.11 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.66 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  30.82 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.79 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.5 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.5 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  28.77 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  32.58 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.69 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.88 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.62 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.25 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  33.1 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.82 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.47 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  29.37 
 
 		 322 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  32.39 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  31.79 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  30.94 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  28.67 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  31.21 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  30.22 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1807  putative universal stress protein  32.45 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.317331 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  26.9 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.54 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.28 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  30.99 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.77 
 
 		 156 aa  43.5  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  31.03 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.13 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.13 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  30 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.47 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  26.9 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.08 
 
 		 314 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.94 
 
 		 317 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  26.39 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  28.77 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.2 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30.46 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 289 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.63 
 
 		 153 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.17 
 
 		 147 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  24.82 
 
 		 144 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  29.22 
 
 		 167 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 311 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  28.97 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.58 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.74 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  31.88 
 
 		 280 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  25.98 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  27.59 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  34.01 
 
 		 324 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  24.14 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  26.24 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.2 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  28.97 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  29.37 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.16 
 
 		 307 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 294 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.49 
 
 		 155 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>