77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1807 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1807  putative universal stress protein  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.317331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0021  hypothetical protein  64.54 
 
 		 143 aa  193  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  37.93 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.47 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  28.47 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2622  universal stress protein  29.08 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  29.58 
 
 		 322 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  28.77 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  28.08 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.41 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  31.94 
 
 		 345 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  28.87 
 
 		 310 aa  50.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  26.24 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.66 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1767  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  28.87 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  27.89 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.89 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  28.66 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  28.37 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  24.32 
 
 		 341 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2957  UspA domain protein  30.97 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0210992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  26.03 
 
 		 288 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  28.1 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  29.73 
 
 		 285 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  28.17 
 
 		 348 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  31.85 
 
 		 308 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.37 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.03 
 
 		 288 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  30.56 
 
 		 305 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.03 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  28.29 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  27.15 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.67 
 
 		 390 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  27.97 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 147 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  27.89 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 		 449 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  27.4 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  23.45 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  25.5 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  27.21 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  27.63 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  25.5 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.86 
 
 		 300 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  27.4 
 
 		 301 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 343 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  30.2 
 
 		 321 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  26.03 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 314 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  28.38 
 
 		 159 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  32.21 
 
 		 174 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 163 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  29.8 
 
 		 317 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 295 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 295 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 295 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  25.5 
 
 		 155 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>