37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0021 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1807  putative universal stress protein  64.54 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.317331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  36.43 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.79 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  32.39 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  25.17 
 
 		 165 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0923  UspA domain protein  28.97 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.840316  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  27.97 
 
 		 308 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.56 
 
 		 321 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  28.87 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2957  UspA domain protein  26.17 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0210992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  28.67 
 
 		 303 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.08 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.97 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.79 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27.14 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  25.53 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  27.05 
 
 		 122 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.57 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  28.67 
 
 		 345 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  27.46 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.58 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  29.45 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 289 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  27.4 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  26.95 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  27.03 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  24.11 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  20 
 
 		 147 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>