174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2957 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2957  UspA domain protein  100 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0210992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1914  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1814  UspA domain protein  37.24 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  34.25 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1638  UspA domain protein  36.23 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170116  normal  0.0161914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  37.59 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.97 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  34.75 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34 
 
 		 339 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  33.1 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 297 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  29.25 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  38 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  34.75 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.79 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  32.62 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  33.12 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  34.51 
 
 		 314 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 289 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.33 
 
 		 308 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.15 
 
 		 295 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 295 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 295 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  31.76 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1105  hypothetical protein  31.88 
 
 		 299 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1122  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 299 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 266 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  36.43 
 
 		 293 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  27.34 
 
 		 315 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  34.01 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 296 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.14 
 
 		 302 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 296 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  33.55 
 
 		 347 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  36.11 
 
 		 285 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 290 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 		 297 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1134  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0540569  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 341 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 		 381 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0009  universal stress protein  30.77 
 
 		 321 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  29.86 
 
 		 341 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 341 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  31.54 
 
 		 308 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  33.57 
 
 		 348 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.21 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  33.11 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  32.14 
 
 		 288 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  29.14 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  30.07 
 
 		 298 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 298 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 290 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 293 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  29.14 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  29.14 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 298 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  29.14 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  29.14 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  31.03 
 
 		 301 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.55 
 
 		 307 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.94 
 
 		 288 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.56 
 
 		 291 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3457  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34 
 
 		 283 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.69 
 
 		 288 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  30.77 
 
 		 281 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3846  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 274 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12659  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.56 
 
 		 295 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  29.94 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  29.14 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0021  hypothetical protein  26.17 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 295 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2082  UspA domain protein  29.17 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000637745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  29.32 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>